健康妇女阴道内有一些病原体存在而没有发生炎症，与女性生殖器官的解剖、生理特点有关，称为自然防御功能，其中阴道上皮细胞含有丰富的糖原，在阴道杆菌的作用下，分解为乳酸以维持阴道正常酸性环境，阴道pH通常为3.8～4.4，使嗜碱性病原菌的活动和繁殖受到抑制，称为阴道自净作用。而子宫颈分泌碱性黏液形成"黏液栓"，抑制嗜酸性病原菌。