防治霍乱必须贯彻"预防为主"的方针，深入开展宣传教育，有针对性地制订预防和控制规划。要抓早、抓紧、抓落实，抓以"三管一灭"（管水、管粪、管饮食、消灭苍蝇）为重点的综合性预防措施。
1．针对传染源的控制措施 疫情发生后，首先要做好疫情的报告工作，提高疫情报告的及时性和准确性。在进行霍乱监测的基础上，做到患者的"早发现、早诊断、早报告"。当发现患者或疑似患者，一面要进行积极搜索传染源并及时处理，一面要利用现有的网络直报系统或以最快（24h内）通信方式（传真、电话等）报告至发病所属县（区）疾病预防控制机构；接到疫情报告的疾病预防控制机构应在最短的时期内对所报疫情进行核实，然后逐级报告上一级疾病预防控制机构及当地卫生行政部门。
对于霍乱患者和未排除诊断的疑似患者都必须按甲类传染病隔离。危重患者应先就地抢救，待病情稳定后在医护人员陪同下送往指定的隔离病房。确诊与疑似病例应分开隔离。凡拒绝隔离治疗或者隔离期未满擅自脱离隔离治疗者，应由政府责成公安部门协助采取强制性隔离治疗措施。在确定的疫点周围人群中要积极巡诊腹泻患者，在尽可能短的时间内搜索正在暴露的霍乱患者和带菌者。疾病预防控制机构在接到霍乱疫情报告后，无论是个案还是暴发疫情，都应视为突发公共卫生事件相关信息，以最快的速度（2h内）赶往事发地，开展流行病学调查与处理。调查与传染源发病前5天内及病后有过饮食、生活上密切接触的人，进行留验，对其排泄物要进行消毒，特别要注意防止污染水源，留验期限为5天。
霍乱作为甲类传染病，只要发生一例，即视为暴发疫情。在发生疫情后，应迅速组织力量核实诊断，判定疫情的严重程度，以便及时采取针对性的控制措施，防止疫情续发、蔓延，并尽快扑灭疫情。视疫情的发生情况，当地人民政府必要时可根据《中华人民共和国传染病防治法》采取紧急措施。
2．针对传播途径的控制措施 主要是执行"三管一灭"。
(1)确保安全饮用水卫生：疫情发生后饮用河水地区，禁止在河内洗涤及下河游泳；饮用塘水地区，提倡分塘用水；饮用井水地区，水井要有栏、有台、有盖、有专用水桶，要有专人负责饮用水消毒；饮用自来水地区，余氯要符合标准。
(2)加强饮食卫生和集市贸易的监督管理：应对疫区内饮食行业从业人员有计划地采便检查。当发现不符合卫生要求时，应做出停止食品出售或责令饮食摊点等停业整顿的处理。
(3)做好渔船民和交通运输的卫生管理：以主管部门和所属乡镇为主，卫生、公安、水产、交通、民政等有关部门密切配合，加强对渔、船民的管理。应逐步完善船只的卫生设施，发现吐泻患者要及时就近诊治。船舶中发现疑似患者，一定要就近停靠，服从管理。对来自疫区的船舶，要加强观察，必要时可对船上人员进行粪检或服药处理。在霍乱流行季节，应加强车辆、船舶、飞机上旅客的医学观察。一旦发现患者或疑似患者时，应就近进行隔离治疗。
(4)强化流动人口的卫生管理：对车站、码头、厂矿、企业、收容所和大型建设工地等流动人口较集中的单位和地区开展预防性卫生监督。
(5)做好粪便管理，改善环境卫生：在城镇，应结合城市建设规划，解决好粪便贮存、污水排放和垃圾处理。粪便管理以不污染环境，并达到杀蛆灭蝇为原则。
(6)灭蝇和灭蟑螂：积极开展和动员群众采用各种有效措施进行灭蝇和灭蟑螂。
(7)限制人群流动，防止传染源扩散：在疫情流行期间，疫区禁止大型集会，必要时暂停集市贸易。
3．针对易感人群的预防措施
(1)免疫预防：可口服灭活全菌体疫苗和减毒活疫苗。
(2)药物预防：给病家和密切接触者预防服药。可根据各地药敏试验情况选择以下药物环丙沙星、诺氟沙星（氟哌酸）、多西环素（强力霉素）、呋喃唑酮（痢特灵）。
(3)加强健康教育：要大力宣传"预防为主"的卫生工作方针，把讲卫生防疾病的方法教授群众，自觉同疾病作斗争。
(4)加强个人防护：进行疫点调查、处理的工作人员应做好个人防护工作，穿戴防护服、口罩、帽子、防护眼镜、胶鞋、橡胶手套等。
(5)严格对疫区、疫点进行消毒等卫生学处理。