（1）股东大会为甲公司提供担保的决议不能通过。根据规定，上市公司在1年内购买、出售重大资产或者担保金额超过公司最近一期经审计总资产30%的，应当由股东大会作出决议，并经出席会议的股东所持表决权的2/3以上通过。股份有限公司的股东所持的每一股份有一表决权。在本题中，该项担保的赞成票为5000万股，未达到出席会议的股东所持表决权（8000万股）的2/3以上。
（2）孙某书面委托其妻吴某代为出席董事会会议不符合法律规定。根据规定，董事会会议应当由董事本人出席，董事因故不能出席的，可以书面委托其他董事代为出席。
（3）董事会不能通过向丙公司销售原材料的决议。根据规定，上市公司董事与董事会会议决议事项所涉及的企业有关联关系的，不得对该项决议行使表决权，也不得代理其他董事行使表决权。该董事会会议由过半数的无关联关系董事出席即可举行，董事会会议所作决议须经无关联关系董事过半数通过。在本题中，董事彭某、华某属于有关联关系的董事，因此无关联关系的董事为10人。出席的人数为7人，符合出席比例的要求。赞成的人数为5人，占无关联关系董事的50%，不符合过半数的要求。