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急性期肾脏较正常增大，病理改变为弥漫性毛细血管内增生性肾小球肾炎。肾小球内增生的细胞主要为系膜细胞和内皮细胞。急性期有较多的中性粒细胞及单核细胞浸润。Masson染色可见上皮下有免疫复合物的沉积。间质中可以有水肿和炎症细胞浸润。免疫荧光检查可见沿毛细血管壁和系膜区有弥漫粗颗粒免疫复合物沉积，使毛细血管壁基底膜明显增厚、肾小球毛细血管腔狭窄，其中主要成分是IgG和C，IgA和IgM少见。电镜检查可见上皮细胞下有"驼峰状"电子致密物沉积。急性链球菌感染后肾小球肾炎不引起肾小球缺血。