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溃疡性结肠炎病因未明。急性期结肠黏膜充血并出现点状出血，黏膜隐窝有小脓肿形成，有大量炎细胞浸润。黏膜表面的脓肿逐渐扩大并形成溃疡，溃疡可融合并相互贯穿形成黏膜桥，残存的肠黏膜可增生形成假息肉，还可见小血管炎、血管壁纤维素样坏死和纤维素性血栓形成。晚期肠壁纤维化。静止期或消散期时炎细胞减少，病变处肠壁黏膜萎缩或大致正常，可见潘氏细胞化生及固有膜内脂肪细胞岛。腺上皮有不典型增生，可恶变为癌。