A选项：异烟肼有肝毒性，肝损害患者禁用是合理的，符合使用原则。
B选项：万古霉素主要经肾排泄，肾损害患者禁用可以避免药物在体内蓄积产生毒性，符合使用原则。
C选项：新生儿可以使用青霉素，但需要谨慎调整剂量，该选项中“新生儿禁用青霉素”不符合抗菌药物使用基本原则，答案是C。
D选项：四环素可影响胎儿骨骼和牙齿发育，妊娠期禁用符合使用原则。
E选项：氯霉素可通过乳汁进入婴儿体内，引起灰婴综合征等严重不良反应，哺乳期禁用符合使用原则。