结核杆菌侵犯肠道的主要途径有经口感染：为肠结核的主要感染方式。血行播散：血行播散也是肠结核的感染途径之一，见于粟粒型结核经血行播散而侵犯肠道。邻近结核病灶播散：肠结核还可由腹腔内结核病灶直接蔓延而引起，如输卵管结核、结核性腹膜炎、肠系膜淋巴结核等。此种感染系通过淋巴管播散。