化脓性脑膜炎病原菌入侵最常见的途径是通过上呼吸道。病原菌先在鼻咽部定植、繁殖，然后通过血行播散到达脑膜引起感染。消化道、脐部、邻近组织、直接接触等途径相对较少见。儿童尤其是婴幼儿，上呼吸道感染较为常见，且其血脑屏障发育不完善，病原菌容易通过血行途径侵入脑膜。