蛋白质翻译后修饰包括：多肽链折叠成天然构象的蛋白质（其中包括分子伴侣、蛋白质二硫键异构酶、肽-脯氨酰顺反异构酶等）、蛋白质一级结构的修饰（肽链N端和C端的修饰、氨基酸残基的化学修饰）、但八只空间结构的修饰。蛋白质二硫键异构酶（PDI）在内质网的活性很高，可催化错配的二硫键断裂并形成正确的二硫键连接，是蛋白质分子内的修饰。