按照微生物有无细胞基本结构、分化程度和化学组成等不同，可将其分为三种类型：①真核细胞型微生物，细胞核的分化程度较高，有核膜、核仁和染色体，胞质内有完整的细胞器；②原核细胞型微生物，细胞核分化程度低，仅有原始核质，没有核膜与核仁，细胞器不完善；③非细胞型微生物，没有典型的细胞结构。