克罗恩病一般起病常较缓慢，病史多较长。主要症状为腹泻、腹痛、低热、体重下降等。粪便隐血试验可呈阳性，一般无便血。腹痛常位于右下腹或脐周，一般为痉挛性痛，多不严重，常伴有局部轻压痛。当有慢性溃疡穿透、肠内瘘和粘连形成时，可出现腹内包块。部分患者出现肠梗阻症状，但多为不完全性临床表现。X线检查如显示回肠末段肠腔狭窄，管壁僵硬，黏膜皱襞消失，呈线样征等和纤维镜检查有助于确诊。少数克罗恩病患者发病较急或在急性阶段，易误诊为急性阑尾炎，但是急性阑尾炎一般以往无低热、腹泻病史，右下腹压痛较局限、固定，白细胞计数增高较显著。