牙周病的始动因子是牙菌斑，因此牙周病的预防重点集中在控制菌斑。因为菌斑在被完全消除后会很快再形成，消除菌斑是不可能的，只要控制菌斑即可预防牙周病，因此B错误。牙周病的致病菌在正常情况下也存在于口腔中，因此控制致病菌也是不可行的，所以C错误。故本题选E。