慢性牙周炎早期治疗效果较好，其治疗目的是彻底清除菌斑、牙石等刺激物，消除牙龈的炎症，牙周袋变浅，改善牙周附着水平，争取适当的牙周组织再生，使病变停止进展，并使疗效能长期稳定地保持，患牙可得以长期保存和行使功能。
由于各个牙的局部刺激因子的多少不同、解剖条件各异、患病程度不等，需对各个患牙逐个制定治疗方案。
1.局部治疗
(1)控制菌斑：向患者讲明菌斑的危害，指导患者保持好口腔卫生，在复诊时检查其菌斑控制程度并记录。
(2)彻底清除牙石，平整根面：洁、刮治是基础治疗，其他治疗手段只应作为补充治疗。清除龈上牙石为洁治术，清除龈下牙石为龈下刮治术，龈下刮治术不仅应刮净牙石，还须将暴露在牙周袋内的含有内毒素的病变牙骨质刮除，使牙龈结缔组织有可能重新附着于根面，形成新附着。
(3)牙周袋及根面的药物处理：炎症严重、肉芽增生的深牙周袋，刮治后可用消炎、收敛药物处理袋壁，多用复方碘液消炎、收敛，注意避免烧灼邻近的黏膜。
(4)牙周手术：直视下彻底刮除根面或根分叉处的牙石及不健康的肉芽组织，修整牙龈和牙槽骨的外形，植骨，截除病变严重的患根，改正牙周软硬组织的外形等。近年来，通过牙周组织引导性再生手术使病变区形成牙骨质、牙周膜和牙槽骨的新附着，使牙周炎的治疗达到了一个更高的层次。
(5)建立平衡的关系：松牙固定术、牙周夹板等，用金属丝结扎并以复合树脂或自凝塑料加固而制成牙周夹板，可以将一组患牙与邻近的稳固牙连接在一起，使力分散，有利于牙周组织恢复。
(6)尽早拔除不能保留的患牙：利于邻牙的治疗和组织修复。
2.全身治疗一般不需使用抗菌药物，但重症患者、常规治疗疗效不佳、急性期时，可全身应用抗菌药物，如甲硝唑、螺旋霉素等。
重症：甲硝唑0.2g，3次/日，7天；螺旋霉素0.2g，4次/日，5～7天。
同时控制全身病如糖尿病、贫血、消化道疾病，这些全身病可能与牙周炎相互影响。劝患者戒烟，因吸烟者对牙周治疗的反应较差。