酶蛋白分离纯化方法包括盐析法、有机溶剂沉淀法、吸附分离法、层析法、电泳法、结晶法等。其中盐析法是最常用方法，无变性作用，易透析脱盐；有机溶剂沉淀法分辨率高，不需脱盐，但易失活，需低温操作；吸附分离法可去杂质并浓缩酶，常用于酶的粗制品分离；电泳法可用于分析和制备，并可测酶蛋白的等电点，需防失活；结晶法得到的结晶酶易保存，但不一定是完全纯化品。