补体活化的MBL途径其激活起始于炎症期产生的蛋白与病原体结合之后。在病原微生物感染的急性期，由肝细胞合成与分泌一种急性期蛋白MBL和C反应蛋白。MBL是一种糖蛋白，属于凝集素家族，正常血清中含量极低，在感染急性期水平升高。MBL可与细菌的甘露糖残基结合，再与丝氨酸蛋白酶结合，形成MBL相关的丝氨酸蛋白酶(MBL-associated serine protease，MASP-1、MASP-2)。该酶具有与活化C1q相同的活性，可水解C4和C2，形成C3转化酶，之后的反应与经典途径相同。C反应蛋白(CRP)也可与C1q结合使之活化，依次激活补体其他成分。