1.嗜肺军团菌常规染色不易着色。患者脓痰革兰染色阴性结果，这表明肺炎与支原体、衣原体、嗜肺军团菌或病毒感染有关。军团病主要发生于那些患有潜在疾病，特别是免疫功能低下和有心肺疾病的人群中，最常见的危险因素包括：年龄的增大、吸烟、慢性梗阻性肺病、气管插管和毛发细胞性白血病等。在本病例中，患者烟瘾严重，伴有肺气肿。对军团病的确诊是从气管引流物中分离培养出嗜肺军团菌，可见，气管引流物是最好标本，其检出率为90%，相比之下，痰液标本检出率为70%。对急性和恢复期患者的血清进行抗体检测也常用于军团病的诊断。
2.嗜肺军团菌为胞内寄生菌。自由活动的阿米巴虫和纤毛虫通过提供军团病菌生长所需的营养而促进其生长。当寄生虫存在于水管设施中时，军团菌将会繁殖到很高的浓度，而当水中没有寄生虫时，军团病菌生长很差。
3.嗜肺军团菌感染常用红霉素治疗，对治疗反应迟缓的可合用利福平。另外，这两种药物也可分别与一种新型大环内酯类药物、复方新诺明、四环素或强力霉素配合使用。免疫力正常的患者用四环素治疗10~14天见效，免疫力低下的患者可能需要更长的时间治疗。大多数有免疫力的患者对治疗很敏感，但是，患有严重潜在疾病的患者死亡率可达50%。通常治疗失败是由于诊断不及时而延迟了治疗。
4.至今尚无有效的军团菌疫苗。预防应强调水源的管理，包括对人工管道系统的消毒处理。