衣原体在宿主体内生长繁殖，有两种不同的颗粒结构原体和始体（网状体）。原体是衣原体的胞外存在形式，与易感细胞表面的特异受体吸附后，通过摄粒作用进入胞内，形成吞噬小泡，原体在泡内胞壁变软、增大形成网状体，RNA增多。大约8小时后始体二分裂增殖，在细胞膜覆盖的空泡内聚集，即称为包涵体。网状体浓缩形成具有坚韧细胞壁的原体，最后细胞破裂释放原体，再感染其他细胞。网状体在胞外不能存活，无感染性。