非发酵菌均为专性需氧菌，半固体穿刺培养细菌缺氧生长不良；压迹法和悬滴法制片后在暗视野显微镜下观察虽然直观，但容易受细菌的状态和外界环境的影响；鞭毛染色虽然操作略微复杂，但能判断细菌有无鞭毛以及鞭毛的类型，对非发酵菌的鉴定具有一定价值。因此本题正确答案是E。