胞内寄生菌是指侵入宿主细胞并能在宿主细胞中繁殖的病原菌。其中比较常见的有：分枝杆菌（如结核杆菌和麻风杆菌等）、化脓性链球菌、化脓性葡萄球菌、沙门菌（如伤寒杆菌等）、嗜肺军团菌、李斯特菌、布鲁杆菌等。麻风分枝杆菌为典型的胞内寄生菌，该菌所在的细胞胞质呈泡沫状，称麻风细胞。