对流免疫电泳实质上是将双向免疫扩散与电泳相结合的定向加速的免疫扩散技术。在pH8.6的缓冲液中，大部分蛋白质抗原成分常带较强的负电荷，在电场中向正极移动；而作为抗体的IgG，等电点偏高（pH6-7），在pH8.6时带负电荷较少，再加上分子量较大，移动速度慢，所以它本身向正极移动缓慢甚至不移动，这样它就会在凝胶的电渗作用下，随水流向负极，电渗引向负极移动的液流速度超过了IgG向正极的移动速度，因此抗体移向负极，在抗原抗体最适比处形成沉淀线，从沉淀相对于两孔的位置还可以大致判断抗原抗体的比例关系。