流感嗜血杆菌主要通过呼吸道感染，引起原发或继发性感染。原发感染多由B型荚膜强毒株引起，为急性化脓性感染，如脑膜炎、鼻咽炎、咽喉会厌炎、化脓性关节炎、心包炎及败血症等。继发感染主要在流感、麻疹、百日咳、肺结核等感染后发生，多为无荚膜菌株引起，如慢性支气管炎、中耳炎、鼻窦炎等。流行性感冒一般是由流感病毒引起的。