有明确潜伏期的感染，自入院起超过平均潜伏期后发生的感染可判定为医院感染。二重感染是指原正常菌群大部分被抑制，只有少数菌种占决定性优势，多因广谱抗菌药物的大量应用使大部分正常菌群消失，而代之以暂居菌或外来菌，并大量繁殖而成为该部位的优势菌。移位菌群失调是指正常菌群由原籍生境转移到外籍生境或本来无菌的部位定植或定居。