中枢免疫器官是淋巴细胞等免疫细胞发生、分化和成熟的场所，包括骨髓、胸腺、法氏囊。骨髓和法氏囊分别是哺乳动物和禽类诱导B细胞分化成熟的场所，胸腺是诱导T细胞分化成熟的场所。外周免疫器官是成熟的T细胞和B细胞栖居、增殖和对抗原刺激产生免疫应答的场所，主要是脾脏、淋巴结和存在于消化道、呼吸道和泌尿生殖道的淋巴小结等。