本病多由毒力较弱的草绿色链球菌引起，少数由肠球菌、肺炎双球菌等引起。常发生于已有病变的瓣膜上（如风湿性心瓣膜病、先天性心脏病等），多侵犯左房室瓣和主动脉瓣。在原有病变的瓣膜上形成由血小板、纤维素、细菌菌落、炎症细胞和少量坏死组织构成的大而松脆的血栓性赘生物。赘生物内的病菌可以不断进入血流而引起相应的临床表现。此外，约2/3患者并发局灶性肾小球肾炎，少数则可并发弥漫性肾小球肾炎。