腹膜炎的结局取决于两方面，一方面是患者全身的和腹膜局部的防御能力，另一方面是污染细菌的性质、数量和时间。细菌及其产物（内毒素）刺激患者的细胞防御机制，激活许多炎性介质。腹膜渗出液中细胞因子的浓度更能反映腹膜炎的严重程度。在病程后期，腹腔内细胞因子具有损害器官的作用。此外，腹内脏器浸泡在脓性液体中，腹膜严重充血、水肿并渗出大量液体，引起脱水和电解质紊乱，血浆蛋白下降和贫血，加之发热、呕吐、肠管麻痹、肠腔内大量积液使血容量明显减少。肠管因麻痹而扩张、胀气，可使膈肌抬高而影响心肺功能，使血液循环和气体交换受到影响，加重休克导致死亡。局限性腹膜炎病变损害轻，邻近的肠管和其他脏器与大网膜发生粘连，将病灶包围使病菌毒力下降，病变局限于腹腔内的一个部位。渗出物逐渐被吸收，炎症消散，自行修复而痊愈。