(一)一般性状检查
1．量 健康成人大多每日排便1次，其量约为100～300g。
2．颜色及性状 正常成人的粪便为黄褐色圆柱状软便，婴儿粪便呈金黄色。病理情况可见：①水样或粥样稀便：见于各种感染性或非感染性腹泻；②米泔样便：见于霍乱患者；③黏液脓样或黏液脓血便：见于痢疾、溃疡性结肠炎、直肠癌等，阿米巴痢疾时，呈暗红色果酱样；④胨状便：见于肠易激综合征；⑤鲜血便：多见于肠道下段出血；⑥柏油样便：见于各种原因所致的上消化道出血；⑦灰白色便：见于阻塞性黄疸；⑧细条状便：多见于直肠癌；⑨绿色粪便：提示消化不良。
3．气味 慢性肠炎、胰腺疾病，尤以直肠癌溃烂继发感染时有恶臭，阿米巴痢疾时有特殊的腥臭。
4．寄生虫体 蛔虫、蛲虫、绦虫节片等较大虫体肉眼即可分辨，钩虫体则须将粪便冲洗过滤后方易找到。
(二)化学检查
1．隐血试验 正常人粪便隐血试验为阴性。其阳性见于：①消化性溃疡的活动期、胃癌、钩虫病以及消化道炎症、出血性疾病等；消化性溃疡呈间断阳性，消化道癌症呈持续性阳性；②服用铁剂、食用动物血或肝类、瘦肉以及大量绿叶蔬菜时，可出现假阳性。
2．胆色素试验 正常人粪便中无胆色素而有粪(尿)胆原及粪(尿)胆素。①大量服用抗生素后，胆红素未能或未被肠道细菌还原成粪(尿)胆原，粪便呈金黄色或深黄色，胆红素定性试验阳性；②阻塞性黄疸患者，排向肠道的胆汁减少，故粪便呈淡黄色乃至灰白色；③溶血性疾病患者的粪便因粪胆原、粪胆素含量增多，多呈深黄色。
(三)显微镜检查
1．细胞 常见细胞有：①白细胞：大量白细胞出现，见于急性细菌性痢疾、溃疡性结肠炎。过敏性结肠炎、肠道寄生虫时，可见较多的嗜酸性粒细胞；②红细胞：见于痢疾、溃疡性结肠炎、结肠癌、痔疮出血、直肠息肉等；③巨核细胞(大吞噬细胞)：见于细菌性痢疾和直肠炎症；④黏膜上皮细胞：结肠炎时增多，假膜性肠炎的黏膜小块、粘胨状分泌物中可见较多的上皮细胞；⑤肿瘤细胞：乙状结肠癌、直肠癌患者的血性粪便涂片可找到成堆的癌细胞。
2．食物残渣 正常粪便中的食物残渣是已充分消化后的无定形小颗粒，仅偶见淀粉颗粒和脂肪小滴等。①淀粉颗粒：腹泻者易见到，慢性胰腺炎、胰腺功能不全时增多；②脂肪小滴：肠蠕动亢进、腹泻及胰腺外分泌功能减退时可见增多，尤其是慢性胰腺炎、胰头癌时。消化吸收不良综合征时，脂肪小滴的量更多，且可见较多的脂肪酸结晶；③肌肉纤维：提示蛋白质消化不良，见于胰腺外分泌功能减退；④植物细胞及植物纤维：肠蠕动亢进、腹泻时增多，严重者肉眼观察即可见到若干植物纤维成分。
3．寄生虫 肠道寄生虫的诊断主要靠镜检查找虫卵、原虫滋养体及其包囊。
(四)细菌学检查 肠道致病菌的检查主要靠培养分离与鉴定，但有时也作直接涂片检查。