银行利率、股市行情是影响国债回购利率变动的主要因素。其中，银行利率对国债回购交易利率的长期变动起决定作用，两者呈同方向变动；股市行情对国债回购利率的短期变动起直接作用，国债回购利率的短期升降与股市行情的涨跌呈同方向变动。除银行利率、股市行情外，时间也是影响国债回购利率变动的因素。