角膜微凹是硬镜在配戴时，空气进入镜片下方被分为大量的小气泡，小气泡被镜片压在角膜上留下的圆形的微凹，特别多配适较陡的硬镜和角膜塑形镜。些分化不全或坏死的基底细胞，积聚成团，在上皮深层出现时一般很难发现，随着，上皮向前方的生长微囊也逐渐移行到上皮的浅层，甚至在上皮表面破溃，表现为针尖样着染。