本题考查个人所得税的征收管理。
A选项，扣缴义务人应当按照国家规定办理全员全额扣缴申报。说法正确。
B选项，经营所得，按年计算，由纳税人在月度或季度终了后15日内，向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报。说法正确。
C选项，非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得的，应当在取得所得的次年6月30日前，向扣缴义务人的居地主管税务机关办理纳税申报。说法正确。
D选项，经营所得在取得所得的次年3月31日前，向经营管理所在地主管税务机关办理汇算清缴。说法正确。
选项E错误，非居民个人在中国境内从两处以上取得工资、薪金所得的，应当在取得所得的次月15日内，由其中一处任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报。
故此题正确答案为ABCD。