药物的理化性质影响直肠吸收的因素：
①溶解度。一般水溶性大的药物易于溶解于体液中，可增加药物与吸收部位的接触面，从而增加吸收。对于脂溶性药物，其油一水分配系数越大，从基质中的释放越缓慢；反之则快。所以，为增加吸收速度，药物以盐形式供用较以对应的盐基形式供用为好，亦可制成包合物。
②粒径。药物在基质中不溶而呈混悬分散状态时，其粒径大小能影响吸收，小粒子的表面积大有利于释放与吸收。因此，一般制备混悬型栓剂的药物都宜微粉化。
③脂溶性与解离度。脂溶性好，未解离型的药物透过性好，容易吸收；未解离的分子愈多，透过性愈好，吸收愈快；高度解离的药物，如季铵盐类化合物透过极微或不透过，很难吸收。通常弱酸性药物pKa＞4.3，弱碱性药物pKa＜8.5，吸收均较快，但如果弱酸性药物pKa＜3，弱碱性药物pKa＞10，吸收则慢。药物的解离度一般受到用药部位pH值的影响，故而降低弱酸性药物pH值或升高弱碱性药物pH值均可增加吸收。