由两个以上的自然人、法人或者其他组织合作开发的软件，其著作权的归属由合作开发者签订书面合同约定。故A正确。接受他人委托开发的软件，其著作权的归属由委托人与受托人签订书面合同约定：无书面合同或者合同未作明确约定的，其著作权由受托人享有。故B有误。由国家机关下达任务开发的软件，著作权的归属与行使由项目任务书或者合同规定：故D有误。自然人在法人或者其他组织中任职期间所开发的软件，针对本职工作中明确指定的开发目标所开发的软件，该软件著作权由该法人或者其他组织享有，该法人或者其他组织可以对开发软件的自然人进行奖励，故C有误。