A项，使用他人作品应当同著作权人订立许可使用合同，许可使用的权利是专有使用权的，应当采取书面形式，但是报社、期刊社刊登作品除外。B项，许可他人使用其注册商标的，许可人应当将其商标使用许可报国家知识产权局备案。C项，专利权人与他人订立的专利实施许可合同，应当自合同生效之日起3个月内向国务院专利行政部门备案。D项，对于合同中著作权人未明确许可的权利，未经著作权人同意，另一方当事人不得行使。E项，商标使用许可未经备案不得对抗善意第三人。