A项，国务院知识产权行政部门处理时，认定侵权行为成立的，可以责令侵权人立即停止侵权行为，没收、销毁侵权产品或者物品。当事人不服的，可以自收到处理通知之日起15日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉。B项，集成电路布图设计专有权的保护客体应是集成电路布图设计。C项，集成电路布图设计登记申请初审主要是对集成电路布图设计申请材料和其他手续的审查。D项，集成电路布图设计的申请文件可以通过面交、邮寄、快递等方式向国家知识产权局提交书面申请文件，也可以登录“集成电路布图设计电子申请平台”通过电子方式提交。E项，转让集成电路布图设计专有权的、许可他人使用其集成电路布图设计的，当事人应当订立书面合同。