专利申请权权属纠纷与专利权权属纠纷之间的区别包括：争议的焦点、发生的时间点以及对技术的保密要求。专利申请权权属纠纷争议的焦点是专利申请权，发生在专利授权前的申请阶段。专利权权属纠纷争议的焦点是专利权，发生在专利授权以后。由于专利申请阶段涉案发明创造可能尚处于未公开状态，因此处理这类纠纷时应更加注意对有关未公开信息进行保密。专利申请权权属纠纷的争议事由与专利权权属纠纷的争议事由具有一致性，都常常发生于职务发明、合作发明、委托发明等领域中。