患者尿痛、尿频、尿道有黄绿色脓性排出物或分泌物，在脓性分泌物中查不到病原菌，高度怀疑沙眼衣原体感染。沙眼衣原体血清型D-K型主要引起泌尿生殖道感染，表现为尿道炎、宫颈炎等；血清型L1、L2或L3主要引起性病淋巴肉芽肿；溶脲脲原体主要引起非淋菌性尿道炎，但症状相对较轻，且一般无黄绿色脓性分泌物；梅毒螺旋体引起梅毒，一期梅毒主要表现为硬下疳，二期梅毒有皮肤黏膜损害等表现；单纯疱疹病毒引起生殖器疱疹，表现为生殖器部位的水疱等。故最可能检查出的病原微生物是沙眼衣原体血清型D-K型，答案选D。