衣原体（A选项）：是原核细胞型微生物，且严格在细胞内寄生。放线菌（B选项）：多数为腐生菌，在自然界广泛分布，不是细胞内寄生。螺旋体（C选项）：如钩端螺旋体等，主要在血液、组织等中，并非细胞内寄生。真菌（D选项）：是真核细胞型微生物，不符合原核细胞型的要求。细菌（E选项）：多数细菌不是细胞内寄生，有自己独立的生存方式。