厌氧菌培养标本最理想的是获取组织深部标本，因为组织深部相对缺氧，有利于厌氧菌的生存和生长，减少其他需氧菌等的污染。外周血一般不易获得厌氧菌；胸腹水可能含有多种杂菌，且不一定能取到深部的厌氧菌；胃肠道内容液含有大量的肠道菌群，不利于准确培养厌氧菌；痰或支气管抽取液也容易被上呼吸道的正常菌群污染，所以答案为E。