在进行同种异体移植时，引起移植排斥反应最强烈的同种抗原当属HLA，在三类HLA分子中，Ⅰ、Ⅲ分子是触发移植排斥反应首要的抗原，尤其是HLA-DR位点的抗原分子，对移植排斥最为重要。其次为HLA-A、HLA-B、HLA-DQ和HLA-DP。HLA-C与移植排斥反应无明显关系。