医院感染监测可分为全面综合性监测和目标监测两类。全面综合性监测是对所有住院患者及医务人员的医院感染及其相关因素（危险因素）进行连续地监测，以了解全院发生医院感染的情况，以及各科室的感染发生率、部位发生率、抗菌药物使用情况各种危险因素、消毒灭菌效果和医务人员的不良习惯等，从而进行针对性的管理及预防。目标监测是在全面综合监测的基础上，针对高危人群、高发感染部位等开展的医院感染及其危险因素的监测，监测内容应包括手术部位感染监测、成人及儿童重症监护病房（ICU）医院感染监测、新生儿病房医院感染监测及细菌耐药物监测。