原发性肾小球疾病的发病机制虽未完全阐明，但一般认为多数肾小球疾病是免疫介导性炎症性疾病，它对肾小球疾病发病起主要作用。遗传性肾脏病、代谢性肾脏病以及感染直接引起的肾小球疾病较为少见。但遗传或遗传免疫可能与病人对肾小球疾病的易感性、病情的严重性和治疗的反应性有关；而一些非免疫因素如高血压与血流动力学、大量蛋白尿、高尿酸、高血脂与代谢感染等因素在疾病的慢性进展过程中可能成为病变持续、恶化的重要因素。