自然疫源性疾病是指某些病原体在自然条件下，即使没有人类参与，也能在野生动物中传播，并在一定条件下可传染给人类的疾病。钩端螺旋体病是一种典型的自然疫源性疾病，鼠类和猪是主要的储存宿主，A选项正确。狂犬病毒主要通过动物咬伤传播给人，不是自然疫源性疾病的典型病原体，B选项错误。肺炎衣原体主要引起人类的呼吸道感染，不是自然疫源性疾病病原体，C选项错误。肺炎支原体主要引起人类的呼吸道感染，不是自然疫源性疾病病原体，D选项错误。汉赛巴通体主要通过猫抓、咬等传播给人，不是典型的自然疫源性疾病病原体，E选项错误。