患儿发热、红色斑丘疹从耳后等部位开始扩散，伴有畏光，且颊部斑丘疹刮取物镜检有大小包涵体和多核巨细胞，咽喉拭子常规细菌培养阴性，未检出抗链球菌溶素O抗体，这些表现符合麻疹的临床特点。猩红热是由A组乙型溶血性链球菌引起，咽拭子培养可发现该菌，且有典型的杨梅舌等表现；伤寒是由伤寒杆菌引起，有持续发热、相对缓脉、全身中毒症状与消化道症状等表现；风疹一般症状较轻，皮疹多在1-2天内出齐；莱姆病是由伯氏疏螺旋体引起的自然疫源性疾病，主要表现为皮肤游走性红斑等。所以该患儿最可能患的是麻疹。