选项A，肺孢子菌感染多见于免疫功能低下者，如艾滋病患者。痰液涂片吉姆萨染色后镜检发现有囊内小体，且囊内小体的胞质呈浅蓝色是肺孢子菌的特征表现，故该选项正确。选项B，申克孢子丝菌主要引起皮肤、皮下组织及其附近淋巴管的慢性感染，与题干症状及检查不符。选项C，白色假丝酵母菌主要引起霉菌性阴道炎、鹅口疮等，痰液检查一般不是吉姆萨染色找囊内小体这种表现。选项D，肺炎链球菌引起的肺炎，痰液检查主要是发现革兰阳性双球菌等，与题干描述不符。选项E，曲霉菌主要引起肺部曲霉菌病，痰液检查特征与题干不符。