适用猪囊虫检查的是活组织检查。因为囊虫可寄生在人体组织内，通过活组织检查（如肌肉活检等）可以发现囊虫。肛拭子主要用于检查肛周寄生虫；血液及骨髓检查主要用于血液寄生虫等；分泌物检查主要用于一些有分泌物的寄生虫；粪便检查主要用于肠道寄生虫检查，对猪囊虫检查不是主要方法。答案是 E。