结肠小袋纤毛虫是人体最大的寄生原虫。它的滋养体呈椭圆形，大小为 (30 - 200)μm×(25 - 120)μm，体表有许多斜纵行排列的纤毛，通过纤毛的摆动进行运动。
溶组织内阿米巴滋养体大小为 12 - 60μm，相对结肠小袋纤毛虫较小，A 选项错误。
弓形虫速殖子呈新月形，大小为 (4 - 7)μm×(2 - 4)μm，比结肠小袋纤毛虫小很多，B 选项错误。
疟原虫在红细胞内寄生，各期疟原虫大小不同，但都远小于结肠小袋纤毛虫，C 选项错误。
人芽囊原虫大小差异较大，但通常也比结肠小袋纤毛虫小，D 选项错误。
所以答案是 E。