首先了解降钙素的作用机制：
降钙素是由甲状腺滤泡旁细胞（C 细胞）分泌的一种肽类激素。它的主要生理功能是降低血钙浓度。
然后分析各选项：
选项 A：甲状旁腺主要分泌甲状旁腺激素，其作用与降钙素相反，是升高血钙浓度，降钙素对甲状旁腺并没有直接的主要作用，所以甲状旁腺不是降钙素的主要靶器官，该选项错误。
选项 B：肝脏主要参与物质代谢、解毒等多种生理功能，降钙素对肝脏并没有直接的主要调节作用，不是降钙素发挥主要作用的部位，所以该选项错误。
选项 C：肾上腺分泌多种激素，如肾上腺素、皮质醇等，主要参与应激反应、水盐代谢等调节，与降钙素的作用关系不大，不是降钙素的主要靶器官，该选项错误。
选项 D：降钙素主要作用于骨组织，它可以抑制破骨细胞的活性，减少骨的溶解和吸收，从而减少钙从骨中释放进入血液，使血钙浓度降低，所以骨是降钙素的主要靶器官，该选项正确。
选项 E：胃肠道在钙的吸收等方面有一定作用，但降钙素对胃肠道并没有直接的主要调节作用，不是降钙素的主要靶器官，该选项错误。
综上，降钙素的主要靶器官是骨，正确答案是 D。