选项A：百日咳是由百日咳鲍特菌引起的急性呼吸道传染病，预防主要采用百日咳疫苗，一般是百日咳-白喉-破伤风联合疫苗（DPT），而不是类毒素单独预防，故A错误。选项B：痢疾主要由志贺菌引起，目前尚无理想的疫苗可以有效预防，主要依靠注意饮食卫生等措施预防，故B错误。选项C：伤寒是由伤寒沙门菌引起的急性消化道传染病，预防主要使用伤寒疫苗，而不是类毒素，故C错误。选项D：白喉棒状杆菌产生的白喉外毒素是主要致病物质，将白喉外毒素用甲醛处理后可制成白喉类毒素，用于预防白喉，故D正确。选项E：结核是由结核分枝杆菌引起的慢性传染病，预防主要使用卡介苗（BCG），是一种减毒活疫苗，不是类毒素，故E错误。