对于衣原体肺炎的诊断，目前临床上最常用的是沙眼衣原体抗原检测法。分离培养法虽然是确诊的“金标准”，但操作复杂、耗时较长，对技术和设备要求高，不适合临床常规应用；分泌物涂片找包涵体特异性和敏感性相对较低；PCR（核酸检测）虽然敏感性高，但存在假阳性等问题，且需要一定的技术条件和设备；血清抗体检测在感染早期可能出现假阴性，且不能区分是既往感染还是现感染。而沙眼衣原体抗原检测法操作相对简便、快速，适合临床常规检测，故答案为D。