新生隐球菌具有宽厚的荚膜，是一种酵母型真菌，主要经呼吸道传播，可引起隐球菌性脑膜炎，尤其在艾滋病患者等免疫功能低下人群中易发生。该患者患有艾滋病，出现脑膜炎症状，脑脊液标本印度墨汁染色镜检见大量有厚荚膜的酵母型菌，符合新生隐球菌感染特点。A选项，白假丝酵母菌虽也可引起机会性感染，但一般无厚荚膜，故A错误；C选项，球孢子菌引起的感染主要是球孢子菌病，其特征与题干不符，故C错误；D选项，脑膜炎奈瑟球菌是细菌，不是酵母型菌，故D错误；E选项，荚膜组织胞浆菌感染的特征与题干描述不符，故E错误。所以答案是B。