(1)沙眼衣原体是原核细胞型微生物，培养需要特殊的细胞培养方法，不能在巧克力培养基培养，选项A错误。脑膜炎奈瑟菌虽然也是革兰阴性双球菌，但主要引起脑膜炎等疾病，通常不是尿道感染的病原菌，选项B错误。粪肠球菌为革兰阳性球菌，且不需要在巧克力培养基和5%-10%CO₂环境下培养，选项C错误。卡他莫拉菌主要引起呼吸道感染，不是尿道感染常见病原菌，选项D错误。淋病奈瑟菌是引起淋病的病原菌，为革兰阴性双球菌，对营养要求高，在巧克力培养基上，置于5%-10%CO₂环境中才能生长良好，符合患者尿道感染且镜下见革兰阴性双球菌的情况，选项E正确。(2)表皮葡萄球菌为革兰阳性球菌，与镜下所见革兰阴性双球菌不符，选项A错误。B群链球菌为革兰阳性球菌，选项B错误。患者尿道脓性分泌物，镜下在中性粒细胞内见到革兰阴性双球菌，符合淋病奈瑟菌感染的特征，选项C正确。沙眼衣原体不能通过革兰染色在镜下直接看到典型形态，选项D错误。脑膜炎奈瑟菌主要引起中枢神经系统感染，而非尿道感染，选项E错误。